Heute finanziert sich der Freundeskreis durch Mitgliedsbeiträge, Spenden, Nachlässe und Gewinne am Kapitalmarkt. Er ist im Hamburger Vereinsregisterunter der Nr. VR 4452 eingetragen und wird jährlich vom Finanzamt geprüft und als gemeinnützig anerkannt.

Zweck und Organisation des Freundeskreises sind in der Satzung des Vereins festgelegt. Der Zweck ist die Unterstützung des BNITM, erfüllt wird er heute durch Förderprogramme, die das Institut auf Grund seiner Satzung nur schwerlich oder gar nicht finanzieren kann. Aktuell konzentrieren sich die Aktivitäten des Freundeskreises auf Stipendien für Promovierende am BNITM und für wissenschaftlichen Nachwuchs aus einkommensschwachen Ländern. Sie werden eng mit der Institutsleitung abgestimmt.

Die Organisation des Vereins gründet sich auf zwei Gremien, zum einen der Mitgliederversammlung, die einmal jährlich tagt und alle Entscheidungen von grundlegender Bedeutung trifft, zum anderen einem ehrenamtlich tätigen Vorstand, der alle drei Jahre von der Mitgliederversammlung gewählt wird und die Geschäfte des Vereins führt.