Bioinformatik

Die Bioinformatikgruppe ist eine integrierte Einheit am BNITM und stellt hierfür die notwendige Infrastruktur für die Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler bereit. Sie ist dabei Ansprechpartner für die Auswertung von Daten aus Hochdurchsatzsequenzierung, die bei vielen Forschungsprojekten am BNITM mittlerweile zum festen Bestandteil des Methodenumfangs gehört. Es wird eine auf Projekt und Bedürfnisse zugeschnittene Beratung und Datenanalyse angeboten. Die Gruppe unterstützt dabei auch aktiv die Planung und Durchführung der Projekte.

Der Fokus liegt auf der Analyse von Vollgenom-, Metagenom- und Transkriptom- Sequenzierungen entsprechend den wissenschaftlichen Fragestellungen der Arbeitsgruppen. Hierbei wird existierende Software in bioinformatische Standardarbeitsabläufe und automatisierte Workflows für strukturierte nachvollziehbare Analysen implementiert und genutzt. Mit dem Support wird ein breites Spektrum an bioinformatischen Methoden abgedeckt das neben standardisierten Qualitätskontrollen, projektbezogene Analysen anbietet. Diese umfassen Genomassemblierungen, Annotationen, Erstellung von Phylogenien, vergleichende Expressionsanalysen, Pan-Genom Analysen, Mikrobiomuntersuchungen und mehr. Für die Auswertungen steht der Abteilung ein High Performance Computer mit 128 Cores und 1 TB Arbeitsspeicher zur Verfügung.